据悉，此次检查的主要内容包括六个方面。
一是整治和优化企业生产经营环境工作的开展情况。重点检查：行政许可收费项目的清理整顿；企业年检和报表的清理和简化；重点部门和重点项目，尤其是部分垄断行业乱收费、乱加价问题的专项治理；对企业乱检查、乱评比、乱培训和强制企业订购书报刊物、音像制品等行为的治理整顿；社会团体和中介机构服务收费的清理规范。
二是非公有制企业治乱减负专项治理工作情况。重点是：全面清理非公企业收费项目工作和进一步优化非公企业经营环境；加大乡镇企业治乱减负工作力度等。
三是加大从源头上预防和治理公路“三乱”力度的情况。重点是：治理向机动车辆乱收费和整顿道路站点工作；高速公路收费联网工作；加强收费公路车辆通行费管理、撤销不合理收费站点以及城市道路收费站点整顿。
四是深入开展“三查”，加大监督检查和执法力度的情况。重点检查开展“三查”活动，抓典型、抓查处、抓曝光的情况和“三乱”案件的查处情况。检查是否健全信访举报制度、案件督办制度、重大案件回访制度和通报制度，是否形成企业负担监督网络体系。
五是企业治乱减负工作机构建设、工作制度建设及立法工作的进展情况。
六是各地可根据自己的实际情况，把企业反映突出、意见较大的问题，列入本地区的检查内容。
2005年全国企业治乱减负工作检查由省级人民政府具体组织实施、各级政府自查自纠，上一级政府要对下一级政府的企业治乱减负工作进行检查，并逐级上报检查情况。国务院减轻企业负担部际联席会议将组织力量对部分省份检查情况进行重点抽查。